secure-clinical-data-agent
Enables secure natural language querying of a clinical SQL Server database using a local Ollama model, with strict SQL validation to protect sensitive data.
README
🏥 Secure Clinical Data Agent (Google ADK & MCP)
Developed as part of the 5-Day AI Agents Intensive Course with Google.
Este proyecto implementa un agente de Inteligencia Artificial diseñado para consultar una base de datos clĂnica SQL Server y responder preguntas estadĂsticas complejas en lenguaje natural. Está construido de manera profesional y modular, aislando los datos sensibles del hospital (PHI) mediante el uso de un modelo local de Ollama y exponiendo el acceso a la base de datos a travĂ©s de un servidor de Model Context Protocol (MCP) reutilizable y seguro.
Arquitectura del Proyecto
agentes-adk/
├── .agents/
│ └── skills/
│ ├── clinical-statistics/ # Skill (Intent Routing y extracción de parámetros)
│
├── src/
│ ├── __init__.py
│ ├── db/
│ │ ├── __init__.py
│ │ ├── connection.py # Conexión a la base de datos (pyodbc)
│ │ └── operations.py # Consultas SQL seguras y Pandas DataFrames
│ ├── mcp/
│ │ ├── __init__.py
│ │ └── server.py # Servidor FastMCP que expone las herramientas de BD
│ └── agent/
│ ├── __init__.py
│ └── agent.py # Configuración del Agente ADK con Ollama y herramientas MCP
├── .env # Variables de entorno (SQL Server, Ollama y API keys)
├── requirements.txt # Dependencias de Python
├── main.py # Consola de chat interactiva con el agente
└── run_mcp.py # Lanzador del servidor MCP independiente (Stdio o HTTP/SSE)
Requisitos Previos
- Python 3.10+
- Driver ODBC de SQL Server: AsegĂşrate de tener instalado "ODBC Driver 17 for SQL Server".
- Servidor de Ollama: Debe estar corriendo en la red local (ej:
xxxx) con el modeloxxxdescargado.
ConfiguraciĂłn de Inicio
1. Preparar el Entorno Virtual
En Windows (PowerShell):
python -m venv .venv
.venv\Scripts\Activate.ps1
Instalar Dependencias:
pip install -r requirements.txt
2. Configurar Variables de Entorno (.env)
Edita el archivo .env en la raĂz con tus credenciales reales:
# ConexiĂłn SQL Server (Se recomienda un usuario de SOLO LECTURA)
DB_HOST=10.xx.0.X
DB_NAME=xx
DB_USER=usuario_solo_lectura
DB_PASSWORD=contraseña_segura
DB_PORT=xxx
# Ollama Local (Resguardo de datos del hospital)
OLLAMA_API_BASE=http://xxx.xxx.xxx.xxx:xxx
LLM_MODEL_QA=xxxxx
EjecuciĂłn del Proyecto
OpciĂłn A: Interfaz de Consola Interactiva (Agente completo)
Este script inicia el agente ADK, el cual levanta automáticamente el servidor MCP de base de datos de forma interna, conectándose a Ollama para procesar tus preguntas:
python main.py
OpciĂłn B: Interfaz Web Oficial de ADK
Puedes interactuar con tu agente utilizando la interfaz web integrada del ADK, ideal para depurar visualmente los pasos cognitivos de Ollama y las consultas SQL ejecutadas:
adk web src/agent
OpciĂłn C: Ejecutar el Servidor MCP de Forma Independiente (SSE)
Si quieres que otros agentes o sistemas externos (como Claude Desktop o cursores de desarrollo) consuman tus consultas SQL, puedes levantar el servidor de base de datos como un servicio web HTTP/SSE independiente:
fastmcp run src/mcp/server.py --transport http --port 8000
Seguridad y Control de Datos
- Modelo Local: Los datos clĂnicos y las consultas de la historia clĂnica se procesan 100% en tu servidor de Ollama (
xxx), por lo que no viajan a internet ni a APIs pĂşblicas de terceros. - ValidaciĂłn de Consultas: La herramienta
query_clinical_statisticsimplementa una verificaciĂłn estricta ensrc/db/operations.pypara asegurar que las consultas del agente comiencen Ăşnicamente conSELECToWITHy rechaza palabras destructivas comoDROP,DELETE,UPDATE,INSERT, etc.
Recommended Servers
playwright-mcp
A Model Context Protocol server that enables LLMs to interact with web pages through structured accessibility snapshots without requiring vision models or screenshots.
Magic Component Platform (MCP)
An AI-powered tool that generates modern UI components from natural language descriptions, integrating with popular IDEs to streamline UI development workflow.
Audiense Insights MCP Server
Enables interaction with Audiense Insights accounts via the Model Context Protocol, facilitating the extraction and analysis of marketing insights and audience data including demographics, behavior, and influencer engagement.
VeyraX MCP
Single MCP tool to connect all your favorite tools: Gmail, Calendar and 40 more.
graphlit-mcp-server
The Model Context Protocol (MCP) Server enables integration between MCP clients and the Graphlit service. Ingest anything from Slack to Gmail to podcast feeds, in addition to web crawling, into a Graphlit project - and then retrieve relevant contents from the MCP client.
Kagi MCP Server
An MCP server that integrates Kagi search capabilities with Claude AI, enabling Claude to perform real-time web searches when answering questions that require up-to-date information.
E2B
Using MCP to run code via e2b.
Neon Database
MCP server for interacting with Neon Management API and databases
Exa Search
A Model Context Protocol (MCP) server lets AI assistants like Claude use the Exa AI Search API for web searches. This setup allows AI models to get real-time web information in a safe and controlled way.
Qdrant Server
This repository is an example of how to create a MCP server for Qdrant, a vector search engine.