Manual RAG — Sistema de Consulta SIH/SUS

Sistema RAG (Retrieval-Augmented Generation) para consulta dos manuais do SIH/SUS, SIA/SUS e portarias relacionadas em linguagem natural, com agente de análise crítica por IA.

Funciona como MCP Server para o Claude Code, expondo 16 tools para consulta do manual, críticas, SIGTAP e CNES.

Instalação rápida

cd scripts/manual-rag
bash setup.sh

O script cria o venv, instala dependências, indexa os documentos (se existirem em ragData/) e registra o MCP server no Claude Code.

Instalação manual

1. Ambiente e dependências

cd scripts/manual-rag
python3 -m venv .venv
source .venv/bin/activate
pip install -e .

2. Alimentar o banco vetorial

Coloque PDFs em ragData/manuais/ e portarias em ragData/portarias/, depois:

python extrair_manual.py --ragdata ragData/
python indexar_manual.py

3. Registrar MCP no Claude Code

# Local (este repo)
claude mcp add manual-sih -- .venv/bin/python mcp_server.py

# Global (qualquer repo)
pip install -e .
claude mcp add --scope user manual-sih -- manual-sih-mcp

Abra uma nova sessão do Claude Code — as 16 tools ficam disponíveis automaticamente.

4. SIGTAP e CNES (opcional)

As tools de SIGTAP e CNES leem Parquet do MinIO. Precisa do container do modulo-processos rodando:

cd modulo-processos && docker compose up -d minio

Copie .env.example para .env e ajuste se necessário:

cp .env.example .env

API Key (para /explicar e analisar_critica.py)

export GEMINI_API_KEY="sua-chave"

Ou salve em arquivo:

mkdir -p ~/.config/google
echo "sua-chave" > ~/.config/google/api_key
chmod 600 ~/.config/google/api_key

Alimentar o banco

Opção 1: Processar todo o ragData (recomendado)

Processa recursivamente todos os arquivos em ragData/ (PDFs, HTMLs, DOCs, ZIPs):

source .venv/bin/activate
python extrair_manual.py --ragdata ragData/
python indexar_manual.py

Opção 2: PDFs individuais

# Múltiplos PDFs
python extrair_manual.py manual1.pdf manual2.pdf

# Adicionar sem apagar existentes
python extrair_manual.py --adicionar novo.pdf

Opção 3: Auto-detecção

Se nenhum argumento for passado, procura *.pdf no diretório raiz do projeto:

python extrair_manual.py

Após qualquer extração, sempre indexar:

python indexar_manual.py

Uso

consulta_manual.py — Consulta interativa

Busca semântica no manual em linguagem natural.

# Modo interativo
python consulta_manual.py

# Consulta direta (uma pergunta)
python consulta_manual.py 'como registrar politraumatizado na AIH'

Comandos no modo interativo:

Comando	Ação
<pergunta>	Busca semântica no manual
/explicar N	Explica como a crítica N é validada (usa IA + RAG + código)
/critica	Modo validação de críticas (busca semântica simples)
/fontes	Lista todas as fontes indexadas com tipo e ano
/secoes	Lista todas as seções do manual
/buscar N	Altera quantidade de resultados (padrão: 5)
sair	Encerra

/explicar N — Como funciona a validação de uma crítica

Combina o código TypeScript da crítica + trechos relevantes do manual + Claude para gerar uma explicação didática:

1. O que a crítica verifica
2. Passo a passo da validação
3. Campos envolvidos
4. Exceções (quando NÃO gera crítica)
5. Fundamentação no manual (com seção e página)

Após a explicação, abre modo interativo para perguntas de follow-up.

Manual SIH> /explicar 92

analisar_critica.py — Agente de Análise Crítica (IA)

Envia o código + trechos do manual para o Claude e recebe um parecer estruturado de conformidade.

# Analisar uma crítica
python analisar_critica.py 92

# Analisar e salvar resultado em data/analises/
python analisar_critica.py 92 --salvar

# Analisar TODAS as críticas
python analisar_critica.py --todas --salvar

O parecer inclui:

• Resumo da regra
• O que o código faz (passo a passo)
• O que o manual diz (com seção e página)
• Veredicto: CONFORME / PARCIALMENTE CONFORME / NÃO CONFORME
• Pontos conformes, lacunas, excessos e riscos
• Recomendações concretas

Após a análise, abre modo interativo para perguntas de follow-up com contexto mantido.

Com --salvar, gera em data/analises/:

• analise_critica_92.json — dados estruturados
• analise_critica_92.md — parecer em markdown

validar_critica.py — Código vs Manual (sem IA)

Mostra o código de uma crítica lado a lado com as seções do manual que a fundamentam.

python validar_critica.py 129

Comandos internos: /codigo (ver código completo), /full (ver todas as seções encontradas)

mapear_criticas.py — Referência cruzada em lote

Mapeia automaticamente todas as críticas de processos-criticas para as seções do manual.

python mapear_criticas.py

Gera tabela no terminal e salva data/mapeamento_criticas_manual.json.

extrair_manual.py — Extração de texto

# Processar todo ragData (PDFs, HTMLs, DOCs, ZIPs)
python extrair_manual.py --ragdata ragData/

# PDFs individuais
python extrair_manual.py manual1.pdf manual2.pdf

# Adicionar sem apagar existentes
python extrair_manual.py --adicionar novo.pdf

Formatos suportados:

• PDF: Manuais SIH/SUS (extração por seções numeradas) ou genérico (por página/parágrafo)
• HTML/HTM: Portarias em HTML (encoding windows-1252/latin-1/utf-8)
• DOC: Documentos legados (via libreoffice --headless)
• ZIP: Extrai e processa recursivamente o conteúdo

Anexos SIGTAP (tabelas de procedimentos) são detectados automaticamente e limitados a 10 páginas.

Salva em data/chunks.json.

indexar_manual.py — Indexação vetorial

Gera embeddings e indexa no ChromaDB. Deve ser executado após cada extrair_manual.py.

python indexar_manual.py

MCP Tools (16)

Tool	Descrição
buscar_manual	Busca semântica no manual SIH/SUS
buscar_critica	Busca crítica por número
listar_criticas	Lista críticas com filtro
buscar_por_secao	Busca seção por número
verificar_citacao	Verifica se seção existe
extrair_dados_aih	Extrai dados de espelho de AIH
ler_codigo_critica	Lê código TypeScript da crítica
contexto_critica	Contexto completo de uma crítica
listar_fontes	Fontes indexadas no banco
listar_secoes	Seções do manual
consultar_procedimento	Procedimento SIGTAP por código
buscar_procedimento	Busca SIGTAP por nome
info_sigtap	Metadata do SIGTAP carregado
consultar_cnes	Dados operacionais de um CNES
buscar_profissionais_cnes	Profissionais de um CNES
info_cnes	Metadata do CNES carregado

Estrutura

scripts/manual-rag/
  ragData/
    manuais/            # PDFs dos manuais SIH/SUS e SIA/SUS
    portarias/          # Portarias (PDF, HTML, DOC, ZIP)
  data/
    chunks.json         # Chunks extraídos
    secoes.json         # Seções detectadas
    analises/           # Pareceres do agente
  db/                   # Banco vetorial ChromaDB
  mcp_server.py         # MCP Server (16 tools)
  s3_client.py          # Cliente MinIO/S3
  sigtap_client.py      # Leitor SIGTAP (Parquet)
  cnes_client.py        # Leitor CNES (Parquet)
  consulta_manual.py    # Consulta interativa + /explicar
  extrair_manual.py     # Extração multi-formato
  indexar_manual.py     # Indexação vetorial
  validar_critica.py    # Código vs manual (sem IA)
  analisar_critica.py   # Agente de análise crítica (com IA)
  mapear_criticas.py    # Referência cruzada em lote
  setup.sh              # Setup automatizado
  .env.example          # Variáveis de ambiente